软件著作权是指对软件程序所享有的知识产权，包括软件程序的版权和专利权。在中国，软件著作权的申请和登记需要通过国家版权局进行。而专为海南地区的软件著作权申请，也需要按照国家版权局的规定进行。
首先，需要明确的是软件著作权的申请费用是由国家版权局规定的，而不是由地区决定的。根据国家版权局的规定，软件著作权的申请费用包括申请费和登记费两部分。
申请费是指提交软件著作权申请时需要缴纳的费用，包括基础费用和过时加收费用。基础费用是根据软件著作权登记申请表中的内容和申请人的身份来计算的，其最高不超过3000元。过时加收费用是在规定的办理时间内未完成申请时需要缴纳的费用，其最高不超过基础费用的50%。
登记费是指在软件著作权申请得到批准后，需要缴纳的登记费用。登记费的收费标准是按照软件著作权登记申请表中的内容和软件著作权登记证书的份数来计算的，其最高不超过2000元。
综合来看，在海南地区申请软件著作权的费用是由国家版权局规定的，不受地区影响。而具体的申请费用需要根据软件著作权登记申请表中的内容和申请人的身份来计算，最高不超过3000元。登记费的收费标准是按照软件著作权登记申请表中的内容和软件著作权登记证书的份数来计算的，最高不超过2000元。
需要留意的是，软件著作权的申请和登记都需要遵循国家版权局的有关规定和要求。如果不熟悉有关规定和要求，建议咨询专业的知识产权律师或代理机构进行申请。