在中国，软件著作权是指对软件程序的著作权，包括源程序、目标程序以及其他描述软件程序的文档等。软件著作权可以借助著作权登记来保护，而著作权登记需要向国家版权局申请并缴纳相应的费用。
对于在新疆地区开发的app软件，其著作权申请的费用与其他地区并无不同。根据国家版权局的规定，软件著作权登记的费用包括申请费和服务费两部分。其中，申请费是指申请著作权登记时需要缴纳的费用，而服务费是指著作权登记后需要缴纳的费用。
具体来说，软件著作权申请的费用包括以下几个方面
1.申请费申请著作权登记需要缴纳的费用，根据申请人的不同身份和申请方法，费用也有所不同。总的来说，企业申请软件著作权登记的申请费为600元/件，个人申请的申请费为300元/件。
2.服务费软件著作权登记后，每年需要向国家版权局缴纳服务费。服务费的标准是根据申请人的不同身份和软件版本的不同而定的。总的来说，企业需要缴纳的服务费为每个软件版本的200元/年，个人需要缴纳的服务费为每个软件版本的100元/年。
需要留意的是，软件著作权登记的申请费和服务费都是根据软件版本计算的。如果一个软件有多个版本，每个版本都需要单独申请著作权登记并缴纳相应的费用。
除了上述的申请费和服务费外，还有其他一些其他的费用也需要考虑。打个比方，如果需要委托专业机构代理软件著作权登记申请，这样的话还需要支付代理费用；如果需要对软件进行修改或更新，还需要重新申请著作权登记并缴纳相应的费用。
总结下来，软件著作权申请的费用是比较可控的，总的来说不会太高。但是，如果需要申请多个软件版本或者需要委托专业机构代理申请，费用就会相应增加。所以呢，在申请软件著作权之前，需要对自己的需求进行充分考虑和计划，以便尽可能地降低申请费用。